127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0385 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 474 aa  961    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  54.46 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  53.87 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  50.71 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  37.6 
 
 		 414 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  36.96 
 
 		 414 aa  273  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  37.79 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  36.1 
 
 		 422 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  37.68 
 
 		 415 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  33.73 
 
 		 413 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  36.76 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2356  RND OM export protein  32.27 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  32.91 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  29.84 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  30.56 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  27.31 
 
 		 453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 427 aa  146  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  28.99 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  26.65 
 
 		 448 aa  133  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  27.11 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 400 aa  127  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 471 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.74 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 421 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  27.16 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.85 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 423 aa  103  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.35 
 
 		 423 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 423 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 423 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  25.88 
 
 		 422 aa  99.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 424 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 443 aa  93.2  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 439 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 439 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 407 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  26.85 
 
 		 425 aa  87  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 437 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  27.86 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  25.77 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2294  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  23.53 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  28.17 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  28.17 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  28.17 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  28.17 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  28.17 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  28.17 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 435 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  28.83 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  26.35 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  25.42 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.51 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.4 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  26.32 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  21.33 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 465 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 415 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 		 433 aa  53.9  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2803  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.887689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  24.86 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.26 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  31.97 
 
 		 475 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  23.05 
 
 		 414 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>