99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4386 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  100 
 
 
427 aa  871    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  84.07 
 
 
427 aa  738    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  40.66 
 
 
400 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  35.37 
 
 
435 aa  253  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  29.43 
 
 
413 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  29.56 
 
 
444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 
474 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  30.13 
 
 
422 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  28.43 
 
 
415 aa  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  28.47 
 
 
414 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  29.62 
 
 
424 aa  143  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 
449 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 
414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  26.42 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  27 
 
 
453 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2356  RND OM export protein  29.37 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  25.12 
 
 
422 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  30 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  27.53 
 
 
448 aa  119  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.35 
 
 
428 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  25.12 
 
 
426 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  25.37 
 
 
471 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 
421 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.31 
 
 
441 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  27.09 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25 
 
 
428 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
418 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25 
 
 
438 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  26.65 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  23.39 
 
 
424 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  26.14 
 
 
451 aa  87.4  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  23.62 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  26.38 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  28.39 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.7 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  22.76 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  23 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.11 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  24.76 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.09 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  27.12 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 
407 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 
440 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  21.68 
 
 
424 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2294  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  25.67 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  23 
 
 
464 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  26.14 
 
 
420 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  23 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  23.47 
 
 
416 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  25.26 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  25.26 
 
 
461 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  25.26 
 
 
461 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  25.26 
 
 
452 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  25.26 
 
 
461 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  25.26 
 
 
461 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  25.26 
 
 
443 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  21.36 
 
 
432 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 
400 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 
432 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
444 aa  50.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  22.6 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 
489 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  24.16 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.19 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.18 
 
 
450 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  22.58 
 
 
504 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 
439 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  22.52 
 
 
436 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.05 
 
 
437 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>