91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3997 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  84.07 
 
 		 427 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 427 aa  872    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  37.82 
 
 		 400 aa  289  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  34.99 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  28.89 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  28.73 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  29.72 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  29.11 
 
 		 424 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  27.58 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 474 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  26.63 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2356  RND OM export protein  27.68 
 
 		 421 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  28.36 
 
 		 472 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  23.6 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  26.86 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  23.64 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.06 
 
 		 441 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  24.88 
 
 		 424 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.19 
 
 		 428 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.13 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 451 aa  87.4  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  22.65 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  25.88 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.57 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  20.88 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.06 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  21.68 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.56 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  27.12 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2294  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  23.95 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  22.53 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.35 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 489 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.08 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  21.04 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  24.9 
 
 		 355 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  20.83 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2803  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.887689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  19.35 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>