294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3557 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 442 aa  840    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  48.97 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  58.1 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  50.53 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  44.29 
 
 		 418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  44.06 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  49.77 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  47.44 
 
 		 426 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  45.35 
 
 		 438 aa  312  9e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  46.46 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  46.17 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  49.18 
 
 		 444 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  53.07 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  43.64 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  43.12 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  38.9 
 
 		 472 aa  259  8e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  41.09 
 
 		 440 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  41.62 
 
 		 415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  40 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  39.64 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  46.43 
 
 		 441 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  40.81 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  41.34 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  41.34 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  41.09 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  41.09 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  41.37 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  41.37 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  41.37 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  41.37 
 
 		 443 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  41.37 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  41.37 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  41.37 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  39.55 
 
 		 416 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  37.82 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  37.82 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  37.82 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  37.82 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  40 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  39.74 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  40.39 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  40.78 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  40.15 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  35.53 
 
 		 438 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  36.03 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  32.74 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  31.74 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  32.91 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  31.13 
 
 		 423 aa  136  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  32.56 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  31.04 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  31.9 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  31.08 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  35.04 
 
 		 437 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  30.51 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  30.1 
 
 		 432 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  30.24 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  32.41 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  31.88 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  28.75 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  32.18 
 
 		 415 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  33.42 
 
 		 429 aa  113  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  31.84 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.65 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  27.2 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 465 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  34.43 
 
 		 425 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  35.07 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  27.86 
 
 		 479 aa  98.2  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  26.78 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.86 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  31.36 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  29.24 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  33.45 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  29.72 
 
 		 434 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  26.9 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5135  outer membrane efflux protein  36.22 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  25.97 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 400 aa  87.4  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  28.92 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  26.08 
 
 		 433 aa  86.3  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  30.96 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  26.02 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  29.5 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  26.85 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  29.64 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  23.04 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  26.91 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  28.16 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  24.02 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>