87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1811 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 440 aa  897    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  40.29 
 
 		 412 aa  332  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  29.82 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  31.05 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  28.87 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  30.25 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  28.36 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  31.35 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  29.17 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 479 aa  97.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.3 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  25.52 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  22.98 
 
 		 440 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  25.64 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  26.59 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  24.87 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  26.77 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  24.87 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  24.87 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  24.87 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  24.87 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  24.87 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  24.87 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  26.26 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.1 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  26 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  23.75 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.21 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  28.9 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.57 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.5 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  22.95 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  24.75 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0405994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  22.69 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  24.13 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  21.17 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  27.68 
 
 		 453 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  24.71 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.52 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  21.27 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  28.23 
 
 		 424 aa  47.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  19.69 
 
 		 409 aa  47  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3231  outer membrane protein  22.32 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 485 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  23.35 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  21.21 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>