115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3978 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  100 
 
 
446 aa  890    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4051  outer membrane efflux protein  91.26 
 
 
455 aa  717    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  40.61 
 
 
424 aa  256  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  38.94 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  39.59 
 
 
424 aa  249  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  39.85 
 
 
424 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  37.91 
 
 
424 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  38.88 
 
 
423 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  29.65 
 
 
426 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  27.5 
 
 
440 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  26.32 
 
 
419 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  28.97 
 
 
445 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 
446 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  27.38 
 
 
501 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 
438 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  25.56 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
443 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.17 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 
424 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.77 
 
 
472 aa  77  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  28.97 
 
 
430 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  25.73 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  24.4 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 
456 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 
417 aa  67  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  27.62 
 
 
491 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  26.49 
 
 
466 aa  63.9  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 
449 aa  62.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  27.88 
 
 
438 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  25.98 
 
 
420 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 
493 aa  60.1  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1554  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 
477 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4430  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  22.67 
 
 
406 aa  57.4  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  24.64 
 
 
425 aa  57  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  24.35 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  27.81 
 
 
442 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 
431 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
439 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
439 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 
477 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  23.69 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  25.92 
 
 
408 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  27.5 
 
 
451 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 
428 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1302  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 
505 aa  55.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 
440 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0648  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 
328 aa  54.3  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  30.85 
 
 
473 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.37 
 
 
428 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.19 
 
 
405 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 
473 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 
473 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 
439 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.36 
 
 
428 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.25 
 
 
428 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 
435 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  26.17 
 
 
452 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  26.17 
 
 
461 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  26.17 
 
 
461 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  26.17 
 
 
461 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  26.17 
 
 
461 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  26.17 
 
 
443 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.41 
 
 
415 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  26.17 
 
 
443 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  24.48 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  24.34 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  25 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  23.97 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3706  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.98 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  26.15 
 
 
429 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
435 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  25.56 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
432 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 
419 aa  46.6  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.43 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  19.31 
 
 
1459 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  22.86 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  24.09 
 
 
426 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.64 
 
 
451 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.26 
 
 
487 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 
432 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 
419 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  27.32 
 
 
418 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
464 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  22.62 
 
 
496 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>