32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4430 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4430  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 443 aa  878    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1554  outer membrane efflux protein  55.86 
 
 		 477 aa  478  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  23.63 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3567  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  28.29 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  20.22 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  28.74 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  21.64 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  26.74 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  28.77 
 
 		 1455 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  20.67 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  27.22 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.73 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.4 
 
 		 1459 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 501 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.81 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.8 
 
 		 487 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  29.29 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 477 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>