162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2313 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 457 aa  912    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  31.38 
 
 		 426 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  27.53 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  31.22 
 
 		 493 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3567  outer membrane efflux protein  29.9 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  28.83 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  29.06 
 
 		 424 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 		 424 aa  127  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 426 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  23.39 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  26.18 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  23.43 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 491 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.15 
 
 		 405 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  28.84 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.89 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.93 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.49 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.36 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  21.16 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.06 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  27.36 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  29.44 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4430  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4051  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  30.25 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  26.99 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  25.73 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  26.08 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  24.81 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  28.09 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  19.95 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1554  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.02 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  24.56 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  24.63 
 
 		 452 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.4 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  24.74 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  24.74 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  24.74 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  24.74 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  23.46 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  21.88 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  24.06 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  24.08 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.28 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  29.39 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  29.39 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  25.57 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  25.89 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.35 
 
 		 532 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116947  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.61 
 
 		 515 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  0.820801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>