53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11753 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  100 
 
 		 405 aa  815    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  55.28 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3567  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.93 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  21.46 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  24.27 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  20.97 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  22.76 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  19.27 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  18.7 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  19.76 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 477 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1503  hypothetical protein  24.88 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0204458  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  18.98 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.49 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  31.63 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  21.84 
 
 		 437 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  21.45 
 
 		 496 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 		 443 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  19.27 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  20.05 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  21.64 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  20.1 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.48 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  22.22 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  18.35 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  20.56 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>