202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2363 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  100 
 
 
419 aa  868    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  34.63 
 
 
438 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  29.87 
 
 
424 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  30.79 
 
 
493 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  30.07 
 
 
426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  28.29 
 
 
440 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  30.22 
 
 
423 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  29.24 
 
 
423 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 
446 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  30.48 
 
 
466 aa  156  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  27.66 
 
 
443 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  29.68 
 
 
501 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 
477 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  27 
 
 
424 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  23.5 
 
 
426 aa  112  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  25.81 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  27.82 
 
 
416 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 
424 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 
473 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 
473 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 
424 aa  103  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  25 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 
457 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4051  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 
493 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1302  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 
505 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  24.58 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  22.47 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.17 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  24.02 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 
453 aa  67  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 
523 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  21.32 
 
 
463 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  19.95 
 
 
427 aa  63.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1275  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.34 
 
 
590 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  22.66 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  21.84 
 
 
431 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 
461 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  22.25 
 
 
443 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 
447 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  21.07 
 
 
439 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  21.07 
 
 
439 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  20.8 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 
491 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  22.25 
 
 
438 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.85 
 
 
470 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  22.31 
 
 
427 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  22.31 
 
 
427 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  21.04 
 
 
435 aa  60.1  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.43 
 
 
495 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  23.93 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  23.24 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  21.14 
 
 
473 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  19.9 
 
 
471 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.78 
 
 
428 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  25.25 
 
 
444 aa  56.6  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  22.93 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.9 
 
 
491 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  20.19 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  19.48 
 
 
521 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  32.5 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  32.5 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  32.5 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 
436 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1503  hypothetical protein  20.24 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0204458  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  20.7 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  21.17 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 
432 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  22.55 
 
 
431 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  20.4 
 
 
458 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  19.95 
 
 
437 aa  53.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.56 
 
 
493 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  20.38 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.14 
 
 
510 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  22.89 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  21.14 
 
 
435 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.92 
 
 
472 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.72 
 
 
498 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  22.59 
 
 
435 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  19.9 
 
 
431 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  21.9 
 
 
428 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>