113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1302 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1302  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 505 aa  1010    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0648  outer membrane efflux protein  84.31 
 
 		 328 aa  537  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  46.51 
 
 		 456 aa  309  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  46.51 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  37.86 
 
 		 493 aa  243  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  28.47 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 		 446 aa  93.6  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  27.89 
 
 		 501 aa  87.4  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 416 aa  86.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.23 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 438 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  25.99 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  24.11 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 465 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  23.85 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  25.12 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  27.27 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  27.27 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  27.27 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  27.27 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  27.27 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  27.27 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  27.27 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  26.1 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.12 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.27 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 541 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  20.6 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  27.48 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  30.32 
 
 		 523 aa  53.9  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  22.97 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  22.56 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  28.32 
 
 		 528 aa  50.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 		 485 aa  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.17 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.11 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  21.88 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.29 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.16 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 473 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 451 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.58 
 
 		 509 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 462 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.04 
 
 		 509 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.8 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 423 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  20.47 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  27.72 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2951  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.23 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.86 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  22.94 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  19.5 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5361  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.13 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.52 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>