202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2435 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  100 
 
 
438 aa  890    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  36.21 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  34.6 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  34.63 
 
 
419 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  33.01 
 
 
423 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 
423 aa  217  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  33.49 
 
 
446 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  31.48 
 
 
440 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  31.83 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  34.1 
 
 
443 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  31.83 
 
 
493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  30.62 
 
 
466 aa  176  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  29.11 
 
 
501 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  29.59 
 
 
424 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  29.72 
 
 
443 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 
424 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  29.49 
 
 
424 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  29.38 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  27.95 
 
 
424 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  25.39 
 
 
426 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  26.55 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 
477 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 
423 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
457 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.19 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 
431 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 
430 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.64 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3070  Outer membrane protein-like protein  23.88 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000236485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  21.23 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 
473 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 
473 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  20.88 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  21.95 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.96 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.84 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  24.51 
 
 
435 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  22.2 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.51 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4430  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.57 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6822  Outer membrane protein-like protein  22.43 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  21.94 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  21.47 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  23.22 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  21.37 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  22.49 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6877  Outer membrane protein-like protein  21.08 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  22.71 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  21.96 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  23.94 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  22.06 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  21 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  21.64 
 
 
441 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  21 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  21 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  21 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1302  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 
505 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  19.52 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  22.53 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 
440 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.71 
 
 
405 aa  67  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 
437 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 
523 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  26.56 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  20.64 
 
 
435 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0648  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 
328 aa  64.3  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3052  Outer membrane protein  20.81 
 
 
417 aa  63.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000151866  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3567  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 
471 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  20.37 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 
491 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.65 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 
427 aa  60.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.22 
 
 
434 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 
443 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  22.93 
 
 
438 aa  60.1  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  20.74 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  22.34 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  21.59 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  19.65 
 
 
416 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  22.08 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  22.27 
 
 
1480 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>