28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6822 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6822  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 441 aa  903    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6877  Outer membrane protein-like protein  89.65 
 
 		 453 aa  703    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3052  Outer membrane protein  49.24 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000151866  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3070  Outer membrane protein-like protein  46.55 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000236485  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1503  hypothetical protein  35.31 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0204458  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  24.03 
 
 		 1469 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  23.31 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  22.96 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  21 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  20.94 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  20.44 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 443 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.74 
 
 		 458 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  22.43 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>