25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6877 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6822  Outer membrane protein-like protein  89.65 
 
 		 441 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6877  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 453 aa  933    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3052  Outer membrane protein  48.73 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000151866  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3070  Outer membrane protein-like protein  45.27 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000236485  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1503  hypothetical protein  35.25 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0204458  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 423 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  24.51 
 
 		 1469 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  23.31 
 
 		 437 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  21.12 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  21.34 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  22.41 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  19.13 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.5 
 
 		 1462 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  23.43 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  21 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  21.8 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  21.25 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2305  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.27 
 
 		 517 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>