14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3070 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3070  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 415 aa  850    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000236485  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3052  Outer membrane protein  67.17 
 
 		 417 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000151866  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6822  Outer membrane protein-like protein  46.25 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6877  Outer membrane protein-like protein  45.55 
 
 		 453 aa  363  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1503  hypothetical protein  36.34 
 
 		 423 aa  242  7.999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0204458  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  21.32 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  21 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  20.62 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  19.15 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>