55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11378 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  826    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  55.28 
 
 		 405 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3567  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  22.43 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  21.52 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  22.28 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.38 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  21.34 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  20.79 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  21.3 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  21.26 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  20.27 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 449 aa  53.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  21.21 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  21.21 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  23.27 
 
 		 477 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  24.63 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  19.89 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  20.96 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  20.96 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.74 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 473 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6877  Outer membrane protein-like protein  23.43 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  20.66 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  19.41 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  22.12 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2776  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.77 
 
 		 487 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.425171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>