112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3567 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3567  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 471 aa  911    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  22.69 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.79 
 
 		 493 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  26.02 
 
 		 440 aa  86.7  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  20.97 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 426 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4430  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  20.83 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  27.42 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  29.15 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1554  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  23.33 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  30.29 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  26.14 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  24.82 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  29.5 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  30.08 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.63 
 
 		 538 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  29.61 
 
 		 417 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  23.26 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  25.24 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 501 aa  53.5  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.98 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.98 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.05 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  29.29 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  28.78 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  21.61 
 
 		 463 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.02 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  20.92 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.95 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.07 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  23.77 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 489 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.64 
 
 		 456 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.08 
 
 		 469 aa  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.95 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  24.26 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.38 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 738 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  20.81 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.46 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.33 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  32.37 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.65 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 432 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.15 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  25.64 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.12 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.51 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  29.44 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.47 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  20.46 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.13 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.13 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.16 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.06 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>