108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3073 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  95.2 
 
 		 419 aa  803    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 419 aa  842    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  72.37 
 
 		 419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  69.21 
 
 		 419 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  65.26 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  58.4 
 
 		 418 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  31.38 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  32.68 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  32.33 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  32.33 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  32.33 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  31.19 
 
 		 430 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.82 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  30.18 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  30.95 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  30.93 
 
 		 412 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  28.13 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  32.24 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  32.04 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  31.61 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  31.61 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  31.44 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  31.02 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  29.71 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.94 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  30.33 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  30.33 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  30 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  30.05 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  29.68 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  29.85 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  27.69 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  29.38 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.35 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  26.6 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  29.82 
 
 		 410 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  27.18 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.28 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  30.07 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  30.07 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  23.58 
 
 		 496 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  28.4 
 
 		 414 aa  86.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  25.7 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  26.14 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  28.33 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  28.33 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  25.57 
 
 		 463 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  23.58 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  36.61 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.12 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  28.16 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  21.24 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.84 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  21.91 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.18 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  23.36 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 423 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 464 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  26.22 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.69 
 
 		 493 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  29.18 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  25.31 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1828  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.28 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>