57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1047 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 491 aa  976    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 457 aa  90.1  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  27.69 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  29.11 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  23.53 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  27.68 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  27.67 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4430  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.44 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  24.84 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3567  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 456 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  26.41 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  23.26 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  21.96 
 
 		 428 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 449 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  24.33 
 
 		 497 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.03 
 
 		 486 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4051  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.61 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1554  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  29.1 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.55 
 
 		 489 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  22.53 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 442 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 443 aa  47.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 495 aa  47  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.1 
 
 		 501 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.039626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.43 
 
 		 516 aa  47  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.65 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.92 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  21.79 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  25 
 
 		 1469 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.72 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.08 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4508  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.31 
 
 		 505 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0567962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 490 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>