More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3077 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 426 aa  867    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  59.09 
 
 		 446 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  61.87 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  60.61 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  55.53 
 
 		 426 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  54.65 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  55.11 
 
 		 493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  52.97 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  36.14 
 
 		 440 aa  269  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  31.68 
 
 		 438 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  33.42 
 
 		 501 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  31.16 
 
 		 466 aa  163  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  30.65 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  29.74 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  27.16 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  28.6 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  27.53 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  27.2 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  29.52 
 
 		 473 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  30.13 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  29.87 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  28.46 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.75 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  25.67 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.88 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  28 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 432 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  23.27 
 
 		 443 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.54 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  23.54 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  24.05 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  23.08 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.62 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.13 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  22.37 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  23.5 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  23.51 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  22.86 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.17 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  24.76 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  22.66 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  22.76 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  22.86 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  24.91 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  23.08 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  23.04 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1302  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 505 aa  67  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.14 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  23.85 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  22.34 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4313  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 528 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 437 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4051  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.29 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  23.81 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  22.77 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  22.77 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  22.77 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  22.77 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  22.77 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  22.77 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.14 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.85 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0511722  normal  0.669116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  23.62 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.36 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  21.21 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  24.53 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.15 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  20.96 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>