244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1619 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  86.67 
 
 		 436 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  100 
 
 		 427 aa  853    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  85.43 
 
 		 433 aa  671    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  85.43 
 
 		 436 aa  672    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 427 aa  853    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  29.95 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  30.35 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  30.48 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 501 aa  126  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  28.36 
 
 		 414 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  26.87 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  29.22 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  24.94 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  27.14 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  29.7 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  26.48 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  30.81 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  28.95 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  30.5 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  29.35 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  25.77 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  30.33 
 
 		 434 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  30.33 
 
 		 434 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  30.85 
 
 		 438 aa  99  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  28.78 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.13 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  30.67 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  24.39 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 466 aa  96.3  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  30.39 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  29.1 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  29.88 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  25.07 
 
 		 473 aa  93.2  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  28.91 
 
 		 419 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 424 aa  90.5  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  27.67 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  29.15 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  24.47 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 443 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 424 aa  87  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 438 aa  86.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  29.79 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.82 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  24.6 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  28.33 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  32.71 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  41.28 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  41.28 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  41.28 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.91 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5768  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.76 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20317  normal  0.984778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  32.32 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  30.16 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6012  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.19 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7725  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.09 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  27.59 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.96 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  26.26 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6180  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.72 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0879819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6660  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.72 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.62 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  22.28 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  31.38 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  32.31 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  27.55 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  31.43 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3621  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.05 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3381  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.47 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>