203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1304 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 493 aa  999    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  42.35 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  42.35 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1302  outer membrane efflux protein  37.86 
 
 		 505 aa  219  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0648  outer membrane efflux protein  35.71 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  27.73 
 
 		 424 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 424 aa  103  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 424 aa  97.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  27.12 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  26.51 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 446 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  25 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  23.18 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.43 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  22.25 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 443 aa  67  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.63 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.72 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.86 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.6 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0808322  hitchhiker  0.00908583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.71 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.76 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4409  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.32 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  25.88 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.17 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  22.61 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.52 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.34 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 453 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2850  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 527 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28382  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.2 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.89 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.91 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  23.94 
 
 		 474 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.6 
 
 		 497 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.91 
 
 		 470 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 433 aa  54.3  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.7 
 
 		 493 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0372  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.44 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.088852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0451  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 459 aa  53.9  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 421 aa  53.9  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.34 
 
 		 485 aa  53.9  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.92 
 
 		 525 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 469 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  23.4 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0980  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.83 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000129951  normal  0.889161 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.48 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1726  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.95 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.95 
 
 		 513 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.24 
 
 		 499 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.2 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.01 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.44 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.72 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  23.76 
 
 		 514 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.44 
 
 		 484 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.55 
 
 		 493 aa  51.2  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.91 
 
 		 501 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.06 
 
 		 449 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 485 aa  50.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 491 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  22.09 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.09 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.68 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  23.69 
 
 		 477 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.39 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  21.98 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.79 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.62 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.36 
 
 		 543 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>