More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4594 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  95.02 
 
 		 515 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.14 
 
 		 593 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  89.12 
 
 		 552 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  65.9 
 
 		 604 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  92.18 
 
 		 543 aa  854    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.27 
 
 		 615 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.07 
 
 		 582 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  77.27 
 
 		 585 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  67.06 
 
 		 515 aa  693    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 529 aa  1053    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.07 
 
 		 582 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.57 
 
 		 601 aa  737    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.27 
 
 		 594 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  65.12 
 
 		 514 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  92.25 
 
 		 525 aa  882    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.07 
 
 		 576 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  92.34 
 
 		 505 aa  848    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  92.14 
 
 		 505 aa  848    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  55.18 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.64 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.24 
 
 		 509 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.24 
 
 		 509 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  54.55 
 
 		 496 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.05 
 
 		 509 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  53.09 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  52.24 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  52.67 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  48.15 
 
 		 504 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  43.72 
 
 		 533 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  43.14 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.22 
 
 		 474 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.68 
 
 		 509 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  37.84 
 
 		 519 aa  296  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.48 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  41.19 
 
 		 489 aa  289  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.15 
 
 		 514 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.55 
 
 		 490 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  38.3 
 
 		 504 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.43 
 
 		 498 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.97 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.24 
 
 		 502 aa  267  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  38.85 
 
 		 505 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.37 
 
 		 514 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.28 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.37 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  38.37 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  38.37 
 
 		 493 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.37 
 
 		 498 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.37 
 
 		 498 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.37 
 
 		 498 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.04 
 
 		 502 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.61 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  34.89 
 
 		 502 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  37.04 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 		 482 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.4 
 
 		 498 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.4 
 
 		 498 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  37.95 
 
 		 492 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.67 
 
 		 502 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.17 
 
 		 498 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.31 
 
 		 489 aa  256  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.81 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.64 
 
 		 498 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.93 
 
 		 498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  37.91 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.83 
 
 		 699 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 		 499 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.41 
 
 		 498 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.53 
 
 		 702 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.17 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.68 
 
 		 483 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.7 
 
 		 493 aa  248  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.45 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.23 
 
 		 517 aa  238  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  36.88 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0323  Fis family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 556 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0561  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.52 
 
 		 629 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 		 504 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.82 
 
 		 491 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0191  putative outer membrane protein  35.2 
 
 		 527 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1014  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.2 
 
 		 527 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998145  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1827  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 527 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0730  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 527 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1916  Outer membrane protein  35 
 
 		 527 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0815  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 527 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0685909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0463  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.805675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  34.24 
 
 		 484 aa  221  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0718  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0239244  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0457  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.555102  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3276  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.08 
 
 		 616 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.08 
 
 		 616 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0523348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.11 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1876  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.11 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138949  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5190  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.86 
 
 		 618 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.85 
 
 		 483 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4504  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.34 
 
 		 605 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5029  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.1 
 
 		 606 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>