More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5896 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  96.05 
 
 
492 aa  841    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  100 
 
 
490 aa  958    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  57.86 
 
 
489 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.29 
 
 
498 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.94 
 
 
482 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  49.57 
 
 
505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.83 
 
 
499 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.84 
 
 
483 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  43.26 
 
 
519 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.81 
 
 
514 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.41 
 
 
509 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.41 
 
 
509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.82 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.82 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.25 
 
 
515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  40.42 
 
 
489 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.73 
 
 
514 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.73 
 
 
498 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.73 
 
 
498 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.73 
 
 
514 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  38.73 
 
 
493 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 
527 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.73 
 
 
498 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.04 
 
 
498 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  38.73 
 
 
498 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  37.91 
 
 
502 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
498 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.8 
 
 
502 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.82 
 
 
498 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.63 
 
 
498 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.4 
 
 
502 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  36.93 
 
 
533 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  37.14 
 
 
502 aa  293  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.56 
 
 
490 aa  289  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.22 
 
 
699 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.24 
 
 
502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 
504 aa  283  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.23 
 
 
504 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  37.42 
 
 
483 aa  279  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  36.83 
 
 
514 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.62 
 
 
604 aa  277  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.74 
 
 
515 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.83 
 
 
480 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.67 
 
 
490 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.12 
 
 
702 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.57 
 
 
509 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.36 
 
 
509 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.65 
 
 
493 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.14 
 
 
509 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.69 
 
 
552 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.45 
 
 
499 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.66 
 
 
529 aa  259  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  38.04 
 
 
475 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  35.9 
 
 
496 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.09 
 
 
525 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.34 
 
 
474 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.91 
 
 
515 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 
543 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.23 
 
 
505 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
504 aa  253  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 
505 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.23 
 
 
616 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0523348  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3276  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.23 
 
 
616 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  36.32 
 
 
594 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  35.67 
 
 
498 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  36.32 
 
 
615 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5190  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.23 
 
 
618 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175856  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  36.32 
 
 
585 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0561  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.87 
 
 
629 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  36.11 
 
 
601 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  36.11 
 
 
593 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  36.11 
 
 
582 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  36.11 
 
 
576 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  36.11 
 
 
582 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.92 
 
 
509 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  34.32 
 
 
504 aa  249  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.84 
 
 
517 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3114  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.74 
 
 
475 aa  247  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  35.08 
 
 
496 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.84 
 
 
517 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.73 
 
 
553 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1876  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.73 
 
 
553 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138949  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0730  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37 
 
 
527 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5029  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.29 
 
 
606 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145963  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1827  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37 
 
 
527 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.62 
 
 
491 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1916  Outer membrane protein  37 
 
 
527 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0815  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37 
 
 
527 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0191  putative outer membrane protein  37 
 
 
527 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1014  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37 
 
 
527 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998145  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4504  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.14 
 
 
605 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0718  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.32 
 
 
531 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0239244  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0463  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.32 
 
 
531 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.32 
 
 
531 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.805675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0457  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.32 
 
 
531 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.555102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.82 
 
 
494 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.79 
 
 
527 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.58 
 
 
527 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0685909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.35 
 
 
483 aa  230  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  34.77 
 
 
484 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>