More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4504 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0561  RND efflux system outer membrane lipoprotein  78.37 
 
 
629 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5190  RND efflux system outer membrane lipoprotein  79.84 
 
 
618 aa  885    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175856  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3276  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  80.33 
 
 
616 aa  874    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108062  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4504  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
605 aa  1182    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  80.33 
 
 
616 aa  874    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0523348  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5029  RND efflux system outer membrane lipoprotein  95.87 
 
 
606 aa  993    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145963  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  65.48 
 
 
553 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1876  RND efflux system outer membrane lipoprotein  65.48 
 
 
553 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138949  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1827  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  63.95 
 
 
527 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0730  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  63.95 
 
 
527 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0191  putative outer membrane protein  63.95 
 
 
527 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.75 
 
 
527 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.75 
 
 
527 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0685909  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0815  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  63.95 
 
 
527 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1014  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  63.95 
 
 
527 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1916  Outer membrane protein  63.95 
 
 
527 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0463  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.43 
 
 
531 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.43 
 
 
531 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.805675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0457  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  63.43 
 
 
531 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.555102  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0718  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  63.43 
 
 
531 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0239244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  38.84 
 
 
490 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  38.41 
 
 
492 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.07 
 
 
509 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.94 
 
 
509 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  33.61 
 
 
519 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  35.75 
 
 
489 aa  243  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.64 
 
 
483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.91 
 
 
514 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  34.91 
 
 
498 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  34.91 
 
 
493 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.7 
 
 
498 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.7 
 
 
514 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.82 
 
 
527 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.7 
 
 
498 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.7 
 
 
498 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.15 
 
 
515 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.78 
 
 
498 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.78 
 
 
498 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.54 
 
 
498 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.62 
 
 
498 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.12 
 
 
498 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.12 
 
 
498 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.95 
 
 
490 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.32 
 
 
502 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  33.78 
 
 
502 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.79 
 
 
514 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.98 
 
 
515 aa  227  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  33.79 
 
 
502 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.54 
 
 
490 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.27 
 
 
489 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  34.84 
 
 
505 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.97 
 
 
498 aa  220  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.77 
 
 
502 aa  220  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  35.07 
 
 
483 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  34.17 
 
 
504 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  33.54 
 
 
496 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  35.03 
 
 
475 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.93 
 
 
504 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.66 
 
 
604 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  33.06 
 
 
533 aa  209  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.02 
 
 
509 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.82 
 
 
502 aa  207  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  31.09 
 
 
514 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.02 
 
 
509 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.35 
 
 
552 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  30.92 
 
 
484 aa  203  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  33.03 
 
 
496 aa  203  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.81 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.07 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 
499 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.26 
 
 
699 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.09 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.79 
 
 
474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.53 
 
 
525 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
529 aa  197  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.46 
 
 
505 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.46 
 
 
505 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.04 
 
 
515 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
543 aa  193  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  32.73 
 
 
615 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  32.73 
 
 
585 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  32.73 
 
 
594 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  32.5 
 
 
582 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  32.5 
 
 
582 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  32.5 
 
 
576 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  32.5 
 
 
593 aa  191  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 
509 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3905  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.16 
 
 
483 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  31.27 
 
 
601 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2518  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  28.54 
 
 
478 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470192  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2361  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  28.33 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2317  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  28.33 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2410  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  28.33 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2406  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  28.33 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  33.26 
 
 
498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.78 
 
 
491 aa  184  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.12 
 
 
702 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0833  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.02 
 
 
478 aa  180  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2273  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.02 
 
 
478 aa  180  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>