More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1427 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  99.6 
 
 		 505 aa  1000    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  90.25 
 
 		 543 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.25 
 
 		 593 aa  705    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  91.65 
 
 		 515 aa  875    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  68.88 
 
 		 604 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 505 aa  1001    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.47 
 
 		 615 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  77.47 
 
 		 585 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.25 
 
 		 576 aa  705    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  65.74 
 
 		 515 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  92.34 
 
 		 529 aa  847    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.47 
 
 		 594 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.83 
 
 		 601 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  90.1 
 
 		 552 aa  838    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.25 
 
 		 582 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  77.25 
 
 		 582 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  99.6 
 
 		 525 aa  1002    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  65.66 
 
 		 514 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  54.36 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.36 
 
 		 509 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  53.73 
 
 		 496 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.94 
 
 		 509 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.94 
 
 		 509 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.15 
 
 		 509 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  53.66 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  53.19 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  53.63 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  48.5 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  42.98 
 
 		 533 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  43.71 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40 
 
 		 474 aa  315  9e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.11 
 
 		 509 aa  300  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.69 
 
 		 509 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  37.85 
 
 		 519 aa  289  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  41.43 
 
 		 489 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.27 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.62 
 
 		 498 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  39.58 
 
 		 505 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.39 
 
 		 515 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.54 
 
 		 490 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.87 
 
 		 490 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.14 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 498 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 498 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 527 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.44 
 
 		 514 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.44 
 
 		 498 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  37.44 
 
 		 493 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.44 
 
 		 498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.44 
 
 		 498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.44 
 
 		 498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  38.44 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.44 
 
 		 514 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.64 
 
 		 502 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.41 
 
 		 502 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  38.03 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 498 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.3 
 
 		 498 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.09 
 
 		 498 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.85 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.72 
 
 		 482 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  35.7 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  36.18 
 
 		 502 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.95 
 
 		 499 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.5 
 
 		 498 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.34 
 
 		 504 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.12 
 
 		 699 aa  248  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.32 
 
 		 483 aa  246  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.77 
 
 		 702 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.26 
 
 		 493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.16 
 
 		 480 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.8 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.14 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  36.97 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0730  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 527 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0191  putative outer membrane protein  35.59 
 
 		 527 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1014  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.59 
 
 		 527 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998145  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1827  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 527 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 504 aa  226  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 527 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.84 
 
 		 491 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1916  Outer membrane protein  35.39 
 
 		 527 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0815  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 527 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103865  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0718  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.5 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0239244  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0463  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.5 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.5 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.805675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 527 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0685909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0457  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.5 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.555102  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0561  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.4 
 
 		 629 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0323  Fis family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 556 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362622 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.82 
 
 		 553 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1876  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.82 
 
 		 553 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138949  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.67 
 
 		 616 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0523348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3276  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.67 
 
 		 616 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108062  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5190  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.4 
 
 		 618 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  33.62 
 
 		 484 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4504  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.35 
 
 		 605 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5029  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 606 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3905  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.66 
 
 		 483 aa  199  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>