224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2062 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  96.79 
 
 		 436 aa  812    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 436 aa  863    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  85.43 
 
 		 427 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  99.77 
 
 		 433 aa  855    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  85.43 
 
 		 427 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  29.16 
 
 		 426 aa  143  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  29.56 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  27.59 
 
 		 501 aa  123  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  28.21 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  30.71 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  30.4 
 
 		 419 aa  107  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  23.8 
 
 		 496 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  31.23 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  30.67 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  29.86 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  25.97 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  29.37 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  31.64 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  31.64 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  30.07 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  24.79 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  25.26 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  28.36 
 
 		 466 aa  97.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  29.03 
 
 		 418 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  29.61 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  30.28 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  30.89 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  30.89 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  31.08 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  30.03 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  31.08 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 443 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  29.28 
 
 		 433 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  25.21 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  24.54 
 
 		 473 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  30.32 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  29.67 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  22.7 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  35.14 
 
 		 473 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  27.6 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  27.55 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  33.51 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  33.51 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  33.51 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  33.51 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  33.51 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  33.51 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.93 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  33.24 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  28.26 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  33.21 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.74 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  32.86 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.75 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.48 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 487 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  26.46 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  29.38 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5768  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.76 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20317  normal  0.984778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  22.98 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.37 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6012  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.19 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7725  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.85 
 
 		 499 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.69 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6180  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.85 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0879819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6660  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.19 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  36 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  36 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  36 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>