155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3400 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  84.65 
 
 		 430 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  85.93 
 
 		 412 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 430 aa  847    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  84.42 
 
 		 430 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 430 aa  847    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  84.65 
 
 		 430 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  99.53 
 
 		 430 aa  843    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  75.06 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  75.06 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  75.06 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  75.06 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  75.06 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  75.06 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  74.81 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  38.7 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  37.22 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  37.01 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  42.34 
 
 		 410 aa  226  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  37.47 
 
 		 438 aa  226  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  34.57 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  34.57 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  34.74 
 
 		 433 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  36.08 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  34.34 
 
 		 433 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  33.33 
 
 		 434 aa  186  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  34.34 
 
 		 433 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  34.63 
 
 		 420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  33.25 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  36.04 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  35.66 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  32.22 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  31.61 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  34.5 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  35.55 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  34.29 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  32.83 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  32.83 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  32.83 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  32.23 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  30.99 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  29.98 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  31.28 
 
 		 407 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  30.81 
 
 		 418 aa  127  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.06 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  32.08 
 
 		 409 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  27.99 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  28.78 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  28.78 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  24.23 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  24.4 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  25.68 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  26.21 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  23.68 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  24 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.29 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  21.45 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.88 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  23.08 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  28.01 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  31.82 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  27.2 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.86 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.46 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  21.45 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  25.42 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>