134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2048 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  100 
 
 
433 aa  829    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  99.54 
 
 
433 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  100 
 
 
433 aa  829    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  100 
 
 
433 aa  829    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  99.77 
 
 
433 aa  827    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  99.54 
 
 
433 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  100 
 
 
433 aa  829    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  70.53 
 
 
430 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  71.98 
 
 
430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  72.43 
 
 
430 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  72.18 
 
 
412 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  71.06 
 
 
430 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  71.06 
 
 
430 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  70.77 
 
 
430 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  38.82 
 
 
428 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  36.45 
 
 
428 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  39.9 
 
 
437 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  42.38 
 
 
410 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  36.92 
 
 
438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  37.25 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  38.06 
 
 
435 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  34.44 
 
 
433 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  34.38 
 
 
433 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  34.62 
 
 
434 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  37.72 
 
 
434 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  37.72 
 
 
434 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  34.09 
 
 
419 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  34.76 
 
 
420 aa  167  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  33.42 
 
 
418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  33.84 
 
 
419 aa  166  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  35.7 
 
 
417 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  35.7 
 
 
417 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  35.7 
 
 
417 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  35.59 
 
 
417 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  33.16 
 
 
419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  35.89 
 
 
417 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  34.62 
 
 
429 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  33.82 
 
 
411 aa  146  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  32.62 
 
 
414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  32.91 
 
 
419 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  34.2 
 
 
408 aa  142  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  31.71 
 
 
407 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  31.08 
 
 
418 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  30.85 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  32.32 
 
 
408 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.25 
 
 
409 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  32.77 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  33.76 
 
 
436 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  33.76 
 
 
433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  27.47 
 
 
426 aa  100  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  28.42 
 
 
449 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  30.84 
 
 
427 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  30.84 
 
 
427 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 
439 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  23.06 
 
 
454 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  24.49 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  25.67 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  25.11 
 
 
463 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  23.81 
 
 
473 aa  77  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  23.89 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  29.76 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  21.29 
 
 
437 aa  67  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  25 
 
 
426 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 
424 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  27.61 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  23.66 
 
 
501 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  26.67 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 
432 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  25.3 
 
 
445 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  26.29 
 
 
418 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.45 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.34 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  24.74 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 
451 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 
416 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  32.77 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  24.3 
 
 
424 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 
418 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.69 
 
 
437 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  27.01 
 
 
445 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  29.96 
 
 
485 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.7 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  31.34 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  29.63 
 
 
473 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>