123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2395 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  100 
 
 		 409 aa  794    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  74.16 
 
 		 408 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  46.04 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  43.93 
 
 		 407 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  37.62 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  37.68 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  37.24 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  35.78 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  35.78 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  35.78 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  36.14 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  37.02 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  35.89 
 
 		 429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  31.47 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  31.28 
 
 		 430 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  33.74 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  30.96 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  32.76 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  31.23 
 
 		 435 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  29.57 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  31.76 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  31.76 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  31.76 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  30.17 
 
 		 419 aa  136  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  30.77 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  33.52 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  33.52 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  30.56 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  32.08 
 
 		 410 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  27.41 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 433 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  28.32 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  32.26 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  29.5 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  29.17 
 
 		 433 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  29.67 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  24.22 
 
 		 496 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  26.37 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  29.25 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  27.25 
 
 		 434 aa  86.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 487 aa  86.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  28.78 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  29.65 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  28.5 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  23.52 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  24.78 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  24.49 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  23.62 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.83 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  27.48 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  24.02 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.3 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  27.05 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  22.89 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.16 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  29.55 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  28.75 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  28.01 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  28.01 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 501 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 438 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  29.75 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  23.99 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.12 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.56 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>