80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1368 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  100 
 
 		 437 aa  890    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  40.73 
 
 		 463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  36.65 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  37.37 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  29.65 
 
 		 447 aa  186  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  29.85 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  27.15 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  28.2 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  28.61 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  26.25 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  24.38 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 501 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  24.16 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  24.73 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.52 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  22.87 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  29.9 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  27.52 
 
 		 426 aa  86.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  23.71 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  20.97 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  23.79 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.4 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  24.6 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  24.19 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  24.05 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  21.84 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  21.15 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  21.8 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.63 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  21.17 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  21.17 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.37 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  24.44 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  20.68 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03275  putative cation efflux protein  34.04 
 
 		 117 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  20.42 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  19.94 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 424 aa  53.5  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 438 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  19.93 
 
 		 1496 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  24.26 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  20.16 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  22.07 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  21.47 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>