279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2929 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  100 
 
 
443 aa  895    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  61.38 
 
 
423 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  61.13 
 
 
423 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  56.44 
 
 
446 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  55.69 
 
 
426 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  56.39 
 
 
424 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  53.86 
 
 
493 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  53.77 
 
 
426 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  36.01 
 
 
440 aa  255  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  34.1 
 
 
438 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  34.6 
 
 
501 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  32.09 
 
 
466 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  29.98 
 
 
426 aa  159  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  30.66 
 
 
416 aa  146  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  28.44 
 
 
424 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  28.1 
 
 
419 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 
424 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  27.59 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  27.29 
 
 
424 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  27.79 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 
443 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 
457 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  30.81 
 
 
477 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.86 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  24.12 
 
 
496 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  30.81 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  30.81 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.94 
 
 
437 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
439 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
447 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  29.49 
 
 
473 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.47 
 
 
434 aa  100  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  27.86 
 
 
435 aa  99.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  26.34 
 
 
454 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
432 aa  96.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 
431 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 
428 aa  90.1  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 
432 aa  90.1  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 
440 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  24.78 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
433 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 
437 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  26.42 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.73 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  20.99 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  24.44 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  23.91 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  23.77 
 
 
461 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  23.77 
 
 
461 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  23.77 
 
 
461 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  23.77 
 
 
461 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  23.84 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  23.91 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  24.21 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  23.95 
 
 
438 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  22.77 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.17 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6822  Outer membrane protein-like protein  25.39 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  22.5 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.42 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  21.91 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3567  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 
471 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  21.84 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  22.54 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  23.44 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.12 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.8 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.64 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  22.17 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 
423 aa  67  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1617  Outer membrane protein-like protein  22.49 
 
 
378 aa  67  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  23.91 
 
 
437 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  22.28 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.13 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 
417 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.615787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>