295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1408 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 466 aa  937    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  35.26 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  33.42 
 
 		 424 aa  212  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  33.57 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  34 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  33.73 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  33.67 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  30.62 
 
 		 438 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  33.25 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  31.08 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  31.16 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  29.67 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  30.77 
 
 		 419 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  28.43 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  32.92 
 
 		 424 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  32.91 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  32.33 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  33.09 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  30.92 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  30.9 
 
 		 423 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 		 436 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 		 433 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  27.99 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  27.99 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  22.38 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  28.65 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  23.91 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  25.13 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  29.02 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  31.57 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  29.02 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  26.74 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.19 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 420 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  27.6 
 
 		 438 aa  90.1  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  24.37 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  27.73 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  22.7 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  22.55 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  26.46 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4430  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  25.14 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.62 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1047  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  23.81 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.81 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.06 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  23.94 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  24.82 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  24.63 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1554  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  24.52 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.08 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.25 
 
 		 408 aa  63.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  23.27 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.44 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  27.46 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4051  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>