112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1261 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 419 aa  841    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  95.2 
 
 		 419 aa  803    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  70.87 
 
 		 419 aa  579  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  69.93 
 
 		 419 aa  551  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  64.52 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  58.4 
 
 		 418 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  30.59 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  31.54 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  33.25 
 
 		 430 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.55 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  33.94 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  33.94 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  33.94 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  31.28 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  31.6 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  30.38 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  29.92 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  31.1 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  32.22 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  32.22 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  32.56 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  32.22 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  29.44 
 
 		 418 aa  136  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.5 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  31.2 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  31.2 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  29.6 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  29.97 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 433 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  29.02 
 
 		 417 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  29.01 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  27.55 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  29.38 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  27.58 
 
 		 433 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  30.08 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.64 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  27.4 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.28 
 
 		 408 aa  99.8  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 449 aa  96.3  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  29.37 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  29.37 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  28.9 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 487 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  28.29 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  23.73 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  26.35 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  26.43 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  25.93 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  26.15 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  22.67 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.63 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  23.97 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.28 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  21.76 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.71 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 501 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.39 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  21.84 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  24.68 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 464 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.54 
 
 		 493 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.57 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0881  hypothetical protein  24.74 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.447891  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 443 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  29.5 
 
 		 451 aa  46.6  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  25.83 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>