232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4257 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  98.73 
 
 
473 aa  875    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  100 
 
 
473 aa  885    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  89.6 
 
 
473 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  60.44 
 
 
477 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  29.45 
 
 
426 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  29.8 
 
 
426 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  28.79 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  32.22 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  29.81 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 
424 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  31.96 
 
 
424 aa  123  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 
446 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  29.53 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  31.84 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  28.05 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  27.48 
 
 
501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  32.97 
 
 
416 aa  113  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  31.18 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  31.04 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  28.01 
 
 
440 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  26.2 
 
 
466 aa  96.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
438 aa  93.6  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  31.09 
 
 
436 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  31.09 
 
 
433 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  31.59 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  25 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  30.34 
 
 
423 aa  87  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  31.12 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  31.12 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  28.21 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  30.7 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.85 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.42 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  31.5 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  29.59 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  28.2 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2967  outer membrane efflux protein  30.25 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  29.64 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  29.64 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.87 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  28.86 
 
 
438 aa  67  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  28.71 
 
 
434 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.87 
 
 
437 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  29.67 
 
 
440 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  29.82 
 
 
458 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  24.67 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
439 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  30.48 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  29.4 
 
 
435 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  30.08 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  27.66 
 
 
439 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.5 
 
 
516 aa  63.9  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  27.66 
 
 
439 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  24.14 
 
 
437 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1275  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.11 
 
 
590 aa  63.9  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
416 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.98 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4441  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 
431 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  27.96 
 
 
408 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  29.07 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  27.2 
 
 
443 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  29.29 
 
 
433 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.54 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 
423 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4790  NodT family outer membrane lipoprotein  27.98 
 
 
496 aa  60.1  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.031941  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  28.78 
 
 
443 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  26.51 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  28.78 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  28.78 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  28.78 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  27.05 
 
 
493 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  28.78 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  28.78 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  26.19 
 
 
499 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  23.74 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  27.38 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  28.78 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3226  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 
503 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303935  normal  0.0862047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  24.16 
 
 
406 aa  58.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  23.51 
 
 
418 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0648  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 
328 aa  57.4  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  28.99 
 
 
412 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  25.38 
 
 
454 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4075  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.87 
 
 
503 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4291  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.87 
 
 
503 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 
495 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  28.81 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4081  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.65 
 
 
517 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  25.36 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.87 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  28.66 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>