63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2967 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2967  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 433 aa  832    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4441  outer membrane efflux protein  72.4 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  27.41 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.82 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.76 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  28.47 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.97 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  29.26 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  28.99 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  31.62 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.33 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.25 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.66 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  30.22 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  30.22 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.74 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  26.26 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  27.2 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  27.2 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  28.53 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  28.42 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.35 
 
 		 518 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  26.21 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  24.41 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.23 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  29.52 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  29.52 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  29.52 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.21 
 
 		 491 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  29.52 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  29.52 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  29.52 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  29.52 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.91 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.73 
 
 		 1458 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  26.65 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 435 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  29.11 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>