19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2803 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 414 aa  818    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1679  hypothetical protein  34.31 
 
 		 409 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0144  hypothetical protein  38.18 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.903633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1463  outer membrane efflux protein  38.89 
 
 		 435 aa  179  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00099491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2707  outer membrane efflux protein  32.73 
 
 		 415 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5677  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin NimC  34.29 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4506  hypothetical protein  36.36 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4374  hypothetical protein  36.36 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3917  hypothetical protein  37.59 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0283416  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5656  hypothetical protein  36.43 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3710  outer membrane efflux protein  35.75 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  28.03 
 
 		 458 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1426  efflux family outer membrane protein  25.32 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  30.82 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  22.32 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  28 
 
 		 432 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>