35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0006 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  100 
 
 		 397 aa  791    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  27.16 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  25 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  24.52 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  21.57 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  23.08 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  19.88 
 
 		 432 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4244  hypothetical protein  31.25 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4299  hypothetical protein  31.41 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3949  hypothetical protein  28.21 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  21.88 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4439  hypothetical protein  31.44 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4064  hypothetical protein  28.21 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0101  hypothetical protein  30.32 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3889  hypothetical protein  27.27 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3856  hypothetical protein  29.13 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00102  Outer membrane protein  24.45 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  20.62 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  22.26 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 485 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.87 
 
 		 523 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>