11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3856 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  775    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3949  hypothetical protein  98 
 
 		 400 aa  762    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4064  hypothetical protein  97.75 
 
 		 400 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4439  hypothetical protein  75.43 
 
 		 407 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4244  hypothetical protein  75.43 
 
 		 407 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0101  hypothetical protein  75.68 
 
 		 407 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4299  hypothetical protein  75.43 
 
 		 407 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3889  hypothetical protein  62.59 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3764  hypothetical protein  62.38 
 
 		 410 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.658461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00102  Outer membrane protein  26.49 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  29.13 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>