11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3949 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3856  hypothetical protein  98 
 
 		 400 aa  762    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3949  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  776    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4064  hypothetical protein  98.75 
 
 		 400 aa  769    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4439  hypothetical protein  75.68 
 
 		 407 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4244  hypothetical protein  75.92 
 
 		 407 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0101  hypothetical protein  75.92 
 
 		 407 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4299  hypothetical protein  75.68 
 
 		 407 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3889  hypothetical protein  62.84 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3764  hypothetical protein  62.62 
 
 		 410 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.658461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00102  Outer membrane protein  26.23 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  28.21 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>