13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00102 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00102  Outer membrane protein  100 
 
 		 374 aa  746    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4439  hypothetical protein  27.31 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3764  hypothetical protein  24.71 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.658461 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3856  hypothetical protein  25.78 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3949  hypothetical protein  25.52 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4064  hypothetical protein  25.52 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0101  hypothetical protein  26.52 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4244  hypothetical protein  26.3 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4299  hypothetical protein  26.14 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3889  hypothetical protein  26.57 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  24.45 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  25.93 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>