14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3764 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3764  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  808    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.658461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4439  hypothetical protein  64.63 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3949  hypothetical protein  62.62 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4064  hypothetical protein  62.62 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4244  hypothetical protein  64.15 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3856  hypothetical protein  62.38 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3889  hypothetical protein  59.75 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4299  hypothetical protein  63.9 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0101  hypothetical protein  63.9 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00102  Outer membrane protein  26.21 
 
 		 374 aa  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  30.59 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  22.99 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  24.5 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>