36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18540 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 426 aa  810    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  56.26 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  58.75 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  61.95 
 
 		 421 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  61.95 
 
 		 421 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  53.96 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  51.78 
 
 		 423 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  53.47 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  46.08 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  34.09 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  34.97 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  31.87 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  24.87 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  31.12 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  24.91 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  30.94 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  28.92 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 472 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  23.55 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  29.2 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  25.99 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 443 aa  46.6  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  27.35 
 
 		 445 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  29.18 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  29.18 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3764  hypothetical protein  28.34 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.658461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.8 
 
 		 636 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  24.24 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  22.66 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  25.94 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  30.45 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>