29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2671 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  100 
 
 		 423 aa  781    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  72.87 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  57.44 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  57.03 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  60.94 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  66.5 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  60.94 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  52.99 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  47.03 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  34.05 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  36.97 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  33.84 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  29.97 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  28.86 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  26.94 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  22.7 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  31.19 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  24.94 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  30.53 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  28.68 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 499 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  30.8 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  28.14 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.88 
 
 		 517 aa  43.1  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>