24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1652 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  812    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  72.32 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  59.39 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  69.95 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  58.65 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  61.31 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  61.31 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  54.98 
 
 		 426 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  48.26 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  35.71 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  37.63 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  33.89 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 454 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  23.92 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  29.07 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  29.93 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  23.51 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  27.94 
 
 		 465 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5103  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.98 
 
 		 502 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  28.08 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  28.08 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3208  putative drug efflux lipoprotein  30.41 
 
 		 486 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332853  normal  0.0695421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>