19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2718 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  795    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  33.25 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  28.61 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  24.52 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  27.35 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  29.44 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.42 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  23.51 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 418 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  25.9 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 485 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>