49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2385 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 421 aa  800    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 421 aa  800    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  60.36 
 
 		 449 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  64.3 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  60.33 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  62.44 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  59.59 
 
 		 423 aa  359  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  57.49 
 
 		 441 aa  342  7e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  49.5 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  38.24 
 
 		 412 aa  167  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  36.06 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  33.01 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  24.29 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  23.46 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  30.02 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  30.95 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.65 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  28.91 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  30.95 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.38 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.95 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  30.32 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.54 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  24.38 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  21.28 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0690  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.3 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  26.63 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  21.43 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  28.38 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.6 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.1 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1706  outer membrane efflux protein  34.21 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2045  outer membrane efflux protein  34.21 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 647 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  21.43 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  18.92 
 
 		 443 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>