21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2151 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 419 aa  852    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  55.3 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  25.84 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  21.74 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  22.05 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.67 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.9 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 489 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>