22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4566 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 449 aa  882    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  59.91 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  63.61 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  63.61 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  56.26 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  58.72 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  54.78 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  56.05 
 
 		 441 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  50 
 
 		 442 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  37.93 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  33.42 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  32.92 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  27.81 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  30.46 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  22.4 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  23.83 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  28.4 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 508 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2041  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 511 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  24.3 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>