32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2620 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  100 
 
 
432 aa  836    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  59.91 
 
 
449 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  65.57 
 
 
421 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  65.57 
 
 
421 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  58.75 
 
 
426 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  61.56 
 
 
431 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  59.32 
 
 
423 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  56.59 
 
 
441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  48.21 
 
 
442 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  34.31 
 
 
395 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  36.26 
 
 
412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  33.75 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 
431 aa  89.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  22.79 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  27.55 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
431 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  20.11 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  29.2 
 
 
451 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  27.81 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  24.43 
 
 
445 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02032  outer membrane protein, probably efflux family  25.58 
 
 
400 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.88 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0477  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.18 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  28.62 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  35.06 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  23.71 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 
465 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  25.87 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>